病菌在种子、病残体及土壤里越冬,并通过雨水飞溅、昆虫或整枝、打杈、采收等农事操作进行传播。田间可以发生多次再侵染,种子带菌也可以造成远距离传播。潮湿、冷凉条件和低温多雨及喷灌有利于发病,一般采用喷灌灌溉的地区比滴灌或沟灌地区发病重。番茄细菌性斑疹病的病原菌为丁香假单胞菌番茄致病变种。病菌可在番茄植株、种子、病残体、土壤和杂草上越冬,在干燥的种子上可存活20年,可随种子作远距离传播。播种带菌种子,幼苗即可发病,幼苗发病后传入大田,并通过雨水、昆虫、农事操作传播,以致造成流行;在田间只要最初有10%的植株发病,就可传染到整个地块,温度25℃以下、相对湿度80%以上的条件有利于病害发生。通常病情的扩展,叶面需保温24小时,在采用喷灌技术的干旱地区易发病,滴灌或沟灌地区发病轻。番茄细菌性斑疹病在环境温度25℃以下,相对湿度80%以上时,有利发病。因此,保护地番茄往往造成严重的危害。