芹菜根腐病主要为害根部和茎基部。被害处开始长生水侵状红褐色病斑，后变为暗褐色或黑褐色，稍凹陷，叶片变黄，由下往上发展，但叶片不脱落。主根被害腐烂或坏死，侧根少，植株萎蔫枯死，容易拔出。防治方法：实行轮作，用无病菌土壤育苗或进行床土消毒。药剂防治：发病初期喷洒80%精碘水剂1000倍液、或50%多菌灵可湿性粉500倍液、或30%绿得宝悬乳剂600倍液，等药剂灌根，每7～10天一次。
芹菜枯萎病发病症状：幼苗感病后，生长缓慢，严重时萎蔫或枯死。成株感病，叶片无光泽，严重时叶片失去绿色或脉间叶肉出现黄绿相间班驳，刨开病茎可见维管束变褐色，根及根茎部，叶柄变为红色，根系腐烂，最后整株枯死。防治方法：选用抗枯萎病品种。采用高畦或起垄栽培。施用腐熟的有机肥雨后及时排水，严禁大水漫灌。重病地实行3年以上轮作药剂防治：发病初期喷洒91%克萎星可溶性粉剂1000倍液。70%甲基托布菌可湿性粉剂，1000倍液、或50%萎菌净可湿性粉800倍液，灌根每株灌0.5升药液，连续灌2～3次。
病菌从根部或茎基部伤口侵入，高温高湿利于发病，最适发病温度24℃左右。要求相对湿度80%以上，特别是在土壤含水量高时有利于病菌传播和侵入。如果地下害虫多，根系虫伤多，也有利于病菌侵入，发病重。
