注意寻找抗病品种。2.加强调查，一经发现初发病株，应尽早挖毁，并对挖毁的病株插上竹标记，对病情继续进行监测，收获时。
主要为蚜虫带毒传播，防治传毒蚜虫：吡蚜酮、氟啶虫胺腈、以及烟碱类杀虫剂(如噻虫嗪、呋虫胺、吡虫啉等)。发病前期到初期：盐酸吗啉胍、寡糖·链蛋白、氨基寡糖素、香菇多糖等。
1、因地制宜选育和换种抗病高产良种。2、加强检查，于当地蚜虫迁飞高峰期及时杀蚜防病，同时挖除病株，以防扩大传染。莲藕病毒病防治农药。在发病初期开始喷药。每隔10天左右1次，视病情连续防治2～3次。药剂可选用20％毒克星可湿性粉剂500倍液，或5％菌毒清可湿性粉剂500倍液，或20%盐酸吗啉双呱·胶铜可湿性粉剂500倍液、或20％病毒宁水溶性粉剂500倍液，或0.5％抗毒剂1号水剂250倍液。
①农业防治。一是合理轮作是目前防治此病最有效的方法，轮作周期一般为2～3年，注意从无病藕田选择健株作种藕，防止带菌传病。二是合理施肥，不偏施氮肥，增强植株抗病性。②药剂防治。种植前，用70%甲基托布津1000倍液或75%百菌清800倍液喷雾闷种，盖农膜密闭24小时，晾干后种植。发病初期，用75%百菌清0.5千克加泥土30千克，拌匀后撒入浅水田内，或用50%多菌灵可湿性粉剂600～800倍液、50%托布津可湿性粉剂800～1000倍液，每隔7～10天喷一次，连喷2～3次，均有一定效果。
莲藕病毒病的防治主要选择适合本地生长发育抗病能力强的优质高产品种，倒茬轮做种植，合理密植，施用发酵腐熟有机肥配合施用一定数量微量元素肥料等。
