灰霉病从辣椒苗期到成株期均可发病。苗期主要危害幼苗的幼叶、嫩茎和顶芽,发病初期子叶先端变黄,逐渐扩展到幼茎,导致缢缩变细,常自病部折倒而死。成株期主要危害叶、茎、花、果。叶片受害多从叶尖开始,形成淡黄褐色病斑,逐渐扩展为“V”形病斑,严重时整叶腐烂。茎部发病初期产生水渍状病斑,扩展后呈长椭圆形或不规则形,病部呈淡褐色,表面生灰白色霉层,严重时病斑可绕茎一周,导致上部枝叶萎蔫枯死。花器受害后花瓣萎蔫脱落。果实受害多从幼果与花瓣粘连处开始,形成水渍状病斑,扩展后引起全果褐斑,病健交界明显,病部有灰褐色霉层。严重时,辣椒会出现烂叶柄、烂花、烂茎、烂果及死棵现象。