洋葱灰霉病发病初期应及时喷施药剂防治，药剂可用50%腐霉·百菌可湿性粉剂800～1000倍液，或50%多·福·乙可湿性粉剂800～100倍液+70%代森联干悬浮剂600～800倍液。发病条件主要以卵孢子随病残体在土壤中存活，秋季侵染幼苗或种株鳞茎内的菌丝体，形成系统侵染。在南方地区因气候温暖病菌可随病株在田间存活。此后，病斑上长出胞子囊借风雨传播，自气孔侵入形成再次侵染。本病遇低温、阴雨或时常出现重雾天气时，则流行较快。在重茬地、地势低洼地以及大水漫灌、过度密植等条件下，发病也较重。洋葱霜霉病以卵孢子在寄主或种子上或土壤中越冬，翌年条件适宜时萌发，从植株的气孔侵入。借风、雨、昆虫等传播，进行再侵染。成株期至采收期发病最重。