防控猪传染性胃肠炎应坚持自繁自养，非购入不可时，严格检疫并隔离观察1个月以上，确认无病后方可合群。平时加强饲养管理，特别是寒冷季节，注意防寒保暖，保持猪舍干燥、清洁卫生。一旦发现本病，立即严格隔离消毒。常用消毒药物包括1～2%烧碱溶液、10%漂白粉溶液、10～20%新鲜石灰乳、10～20%热草木灰水及0.5～2%甲醛溶液，效果良好。
防治措施包括：(1)加强卫生管理，保持猪舍干燥清洁，地面和用具经常消毒。(2)坚持自繁自养，尽量避免从外地引进猪只。(3)对已发病的猪进行隔离，防止传染，并进行消毒。病猪康复后能产生一定免疫力，可保持一年左右，利用痊愈血清预防和治疗仔猪传染性胃肠炎效果良好。(4)使用黄连素、高锰酸钾等药物抑制继发细菌感染，加速康复。对脱水严重的病猪应补生理盐水和葡萄糖，缓解病情。
目前尚无特效药物，停食或减食，多给清洁饮水或易消化饲料，小猪进行补液、补液盐等措施有一定作用。由于此病发病率高、传播快，一旦发病，隔离、消毒等措施效果有限。康复猪可产生一定免疫力，猪只发病流行后即可停止。可试用猪传染性胃肠炎弱毒疫苗预防。平时注意不从疫区或病猪场引进猪只，以免传入本病。当猪群发生本病时，立即隔离病猪，对猪舍、环境、用具、运输工具等进行消毒，尚未发病的猪应立即隔离到安全地方饲养。
