病原可在种子上越冬，也可以菌丝块在病残体或菌丝在病叶上越冬，成为初侵染源。病菌以菌丝体随病残体在土壤中越冬，种子也能带菌越冬。田间发病后病部产生分生孢子，借风雨、灌溉水和工具传播蔓延。病菌喜温暖高湿条件，20～25℃适宜发病。相对湿度80%开始发病，湿度愈大发病愈重。植株生长不良易发病。
辣椒褐斑病常始于苗床，高温高湿持续时间长，有利于该病扩展。气温在20~25℃时易发病，相对湿度80%开始发病，湿度越大发病越重。植株衰弱、低洼地带、贫瘠地块病情表现严重。辣椒褐斑病在苗期就可侵染，在中国4-5月发病重，高温高湿有利于病害发生。
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