加强植物检疫，选用抗病稻种，对稻种进行消毒，药剂可用强氯精浸种。整治排灌系统，防止漫灌、串灌。施肥时适当增施磷、钾肥，防止过量、过迟施用氮肥。大雨过后，应立即排水。及时进行施药防治，气候对发病有利应连续施药2-3次，每7-10天一次，药剂可用链霉素、施稻灵、裁果和细菌立灭。细菌性条斑病危害稻叶时，苗期或大田稻叶上看到有条斑出现时，应立即喷药防治，常用的杀菌农药有噻森铜、叶青双、消菌灵等。用链霉素、叶枯唑、辛菌胺、中生菌素、噻菌铜、噻森铜、喹啉铜、氯溴异氰尿酸交替或混合使用加磷酸二氢钾喷雾，间隔5天连续喷施2到3次。对发病田块及往年重发区和低洼积水田块应及时进行施药防治，药剂可用农用链霉素、施稻灵、裁菌、细菌立灭。