芹菜根腐病全生育期都可侵染，主要为害根部和茎基部。苗期发病，初时地上部植株生长缓慢、中午萎蔫，底叶发黄，但不脱落；随着病情发展，病株全部叶片萎蔫枯死。病株根部，开始产生水浸状红褐色斑，后来变为暗褐色或黑褐色，稍凹陷，严重时主根腐烂或坏死，侧根少，容易拔出。
防治方法：
1.实行轮作：用无病菌土壤育苗或进行床土消毒。
2.科学用肥：注意增施生物有机肥和磷钾肥，减少和防止单一使用氮肥。同时要加深耕层，增加土壤的透气性。
3.药剂防治：
播前结合整地，可用质量好的70%甲基硫菌灵可湿性粉剂1～2千克处理土壤。
移栽西芹时，可用中农蘸根三宝套餐1盒(内装护瑞2袋、瑞苗清2袋、五谷盈1袋)，对15千克水蘸根后随即栽植。
发病初期，随时拔掉病株，每亩用30%瑞苗清(甲霜·恶霉灵)水剂400毫升、或30%瑞苗清(甲霜·恶霉灵)水剂200毫升+40%卫福(萎锈·福美双)悬浮剂200毫升、或30%瑞苗清(甲霜·恶霉灵)水剂300毫升+46%可杀得叁千(氢氧化铜)水分散粒剂100克，随灌溉水均匀冲施。药后15天左右，视病情再用上述配方救治一次为佳。
当病害刚发生时，可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或70%敌克松可湿性粉剂800-1000倍液灌根，每10天灌一次，连灌两次。
