合理分配基肥、追肥的比例。一般情况下，有机肥、微肥、80%的磷肥、50%的钾肥和30%的氮肥混匀后做基肥，其余70%的氮肥、20%的磷肥和50%的钾肥分别做追肥使用。对于部分微量元素如硼砂可叶面喷施。
辣椒的底肥可撒在地里，然后翻到20厘米至30厘米深的土壤里。底肥要用腐熟的农家肥和化肥混合均匀使用，建议用测土配方来决定施肥用量。辣椒施基肥时宜用迟效肥料，这是促使缓苗后加快生长、提高封行、夺取高产的有效措施。应以有机肥为主，每亩施用6000公斤腐熟的优质有机肥。也可用过磷酸钙30公斤，与有机肥料混合均匀后，结合整地沟施或穴施。
在植株移栽成活后，每亩可用1%硫酸铵水溶液400公斤根施。辣椒现蕾以后，每亩追施人粪尿600公斤，或硫酸铵15公斤对水成5%溶液进行点浇。盛果期，辣椒需要大量的营养物质，如果营养不足，不但影响结果，而且植株生长受到抑制，这一时期应以促为主，每亩追施三元复合肥15公斤或优质人粪尿1000公斤。
