加强小麦的栽培管理,适期播种小麦,促进小麦幼苗及早出土,减少病菌感染。在小麦发病区域进行深耕翻土,并施用腐熟的农家肥。冬小麦的种子必须经过拌种才能播种,可用2%立克秀拌种剂10-15g,加入少量水调成糊状液体与10kg麦种混匀,晾干后播种。也可用种子重量0.15%-0.2%的20%粉锈宁或0.2%的40%福美双、0.2%的40%拌种双、0.2%的50%多菌灵、0.2%的70%甲基硫菌灵、甲基托布津、0.2%-0.3%的20%萎锈灵等进行药剂拌种和闷种,都有较好的防治效果。常年发病较重地区用2%立克秀拌种。春麦不宜播种过早,冬麦不宜播种过迟。播种不宜过深。播种时施用硫铵等速效化肥做种肥,可促进幼苗早出土,减少侵染机会。冬麦提倡在秋季播种时,基施长效碳铵1次,可满足整个生长季节需要,减少发病。要防治小麦黑穗病,应将麦种进行冷温浸种,并使用三唑酮可湿性粉剂拌种,然后再适时播种。发病前期或发病初期使用多菌灵可湿性粉剂或拌种双可湿性粉剂进行防治。提倡施用酵素菌沤制的堆肥或施用腐熟的有机肥,对带菌粪肥加入油粕或青草保持湿润,堆积1个月后再施到地里,或与种子隔离施用。