棉花褐斑病是由棉小叶点霉和马尔科夫叶点霉引起的病害,这两种病原菌属于腔孢纲、球壳孢目、球壳孢科、叶点霉属真菌。病原菌的分生孢子器呈球形、扁球形、凸镜形或近圆锥形,初生时埋生于叶片的叶肉组织表面内,由棉叶的表皮覆盖,随着分生孢子器不断增大,后期突破表皮而外露。分生孢子器壁薄呈膜质,深褐色,有明显的稍凸的孔口,孢子器成熟后遇水时膨胀,器孢子从孔口挤出成丝钮状,但遇水后即迅速分散而成悬浮液。病原以菌丝体和分生孢子器在病残体上越冬,第2年从分生孢子器中释放出大量的分生孢子,通过风雨传播到棉叶上引起病害。后在叶片组织里产生分生孢子器,释放分生孢子进行再侵染。病菌的寄生性强,几乎全部寄生于寄主的叶组织上,造成明显的病斑。