玉米褐斑病发生在玉米叶片、叶鞘、茎秆和苞叶上。叶片上病斑圆形、近圆形或椭圆形,小而隆起,直径仅1毫米左右(发生在中脉上的,直径可达3~5毫米),常密集成行,成片分布。病斑初为黄色,水浸状,后变黄褐色、红褐色至紫褐色。后期病斑破裂,散出黄色粉状物(病原菌的休眠孢子囊)。病叶片可能干枯或纵裂成丝状。茎秆多在节间发病,叶鞘上出现较大的紫褐色病斑,边缘较模糊,多个病斑可汇合形成不规则形斑块,严重时,整个叶鞘变紫褐色腐烂。果穗苞叶发病后,症状与叶鞘相似。中国以外还发现该菌能引起严重的茎腐症状,病株茎基部第节或第二节变黑褐色腐烂,致使病部开裂、折断,病株倒伏。
叶片症状常出现在苗期至拔节期,多为聚集的褪绿至黄枯、有时为褐色的直径约1mm的小斑点;成株期,发病植株叶鞘上也可见许多散生的深褐色、直径3~4mm的斑点;苞叶上偶见褐色斑点。玉米褐斑病病菌侵染叶片、叶鞘及茎秆,以叶片与叶鞘连接处病斑最多,常密集成行。病斑圆形或椭圆形,褐色至红褐色,小病斑有时汇成大斑,病斑附近的叶组织常呈粉红色。发病后期,病斑表皮破裂,散出褐色粉末,叶脉和维管束残存如丝状。茎上病斑多发生于节的附近,遇风易倒折。