在苗枯病发病初期及时用药。可用70%甲基硫菌灵800倍液,或者恶霉灵3000倍,连喷2次(每次用药间隔7天左右)。播种前先将种子翻晒1~2天。药剂浸种用40%克霉灵600倍液或70%甲基托布津500倍药液浸40分钟,晾干后播种;也可用2.5%咯菌腈悬浮种衣剂10克加水100毫升,拌种5公斤;或者25%戊唑醇2克,拌种5公斤,同时预防丝黑穗病。防止玉米苗枯病,要选用优良的玉米品种,进行种子处理,发病初期喷洒70%甲基硫菌灵800倍液,连喷两次可有效防治和控制苗枯病。可用50%多菌灵可湿性粉剂,按种子量的0.2%~0.3%拌种,华阳20%的玉米专用种衣剂或使用包衣种子,既杀虫又壮苗,一举多得。另外,近两年应用新型种衣剂25%适乐时0.2%拌种,防治效果可达90%以上。喷药的同时可加入喷施农喜十乐素、蓝色晶典、壮汉、六高二氢钾高效营养调节剂,以促苗早发,以增强植株抗逆、抗病力,可有效防治和控制苗枯病。